长期致力于新药发现和药物设计研究，是我国药物分子设计领域的重要开拓者之一，两次担任973计划项目首席科学家，在药物分子设计方法和技术的发展、新药先导化合物的发现和优化等方面取得一批优异成果。迄今在学术期刊上发表论文270多篇，获专利授权20余项；曾获上海市科技精英、何梁何利科技进步奖、首届全国科技创新争先奖、中国药学会突出贡献奖、国家技术发明二等奖等多项奖励。1999年当选为中科院院士，2011年被选为上海市科学技术协会主席。

2001年被科技部聘任为国家重大项目“创新药物和中药现代化”总体专家组成员。2008年至今，先后担任国家科技重大专项“重大新药创制”总体专家组成员和技术副总师，参与组织和推动一系列创新药物研究和开发。现任国家药典委员会副主任，中国药学会监事长、药物化学专业委员会主任委员，中华中医药学会副会长。为推动我国创新药物研发和药物创新技术体系建设，为中医药现代化、国际化做出了贡献。